Protein–RNA interactions for Protein: Q8BP99

UPF0500 protein C1orf216 homolog, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BP99 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q8BP99 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Q8BP99 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q8BP99 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q8BP99 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q8BP99 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q8BP99 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Q8BP99 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q8BP99 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q8BP99 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Q8BP99 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q8BP99 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q8BP99 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q8BP99 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q8BP99 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q8BP99 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Q8BP99 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q8BP99 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Q8BP99 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q8BP99 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q8BP99 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q8BP99 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q8BP99 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q8BP99 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q8BP99 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q8BP99 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q8BP99 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q8BP99 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q8BP99 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q8BP99 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q8BP99 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q8BP99 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q8BP99 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q8BP99 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q8BP99 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
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Q8BP99 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Q8BP99 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Q8BP99 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q8BP99 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q8BP99 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q8BP99 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q8BP99 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q8BP99 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
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Q8BP99 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q8BP99 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q8BP99 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q8BP99 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q8BP99 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q8BP99 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q8BP99 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q8BP99 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q8BP99 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q8BP99 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q8BP99 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q8BP99 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Q8BP99 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q8BP99 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Q8BP99 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Q8BP99 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Q8BP99 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q8BP99 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q8BP99 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q8BP99 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q8BP99 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q8BP99 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q8BP99 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q8BP99 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q8BP99 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q8BP99 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q8BP99 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q8BP99 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q8BP99 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q8BP99 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q8BP99 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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