Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZS5

Cldn34b3, Claudin 34B3, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b3Q80ZS5 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Cldn34b3Q80ZS5 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Cldn34b3Q80ZS5 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Cldn34b3Q80ZS5 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn34b3Q80ZS5 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cldn34b3Q80ZS5 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cldn34b3Q80ZS5 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cldn34b3Q80ZS5 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cldn34b3Q80ZS5 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cldn34b3Q80ZS5 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cldn34b3Q80ZS5 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cldn34b3Q80ZS5 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cldn34b3Q80ZS5 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cldn34b3Q80ZS5 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cldn34b3Q80ZS5 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn34b3Q80ZS5 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn34b3Q80ZS5 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn34b3Q80ZS5 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn34b3Q80ZS5 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn34b3Q80ZS5 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn34b3Q80ZS5 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn34b3Q80ZS5 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn34b3Q80ZS5 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn34b3Q80ZS5 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn34b3Q80ZS5 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn34b3Q80ZS5 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn34b3Q80ZS5 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn34b3Q80ZS5 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn34b3Q80ZS5 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn34b3Q80ZS5 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn34b3Q80ZS5 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn34b3Q80ZS5 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
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