Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS3

Ssx9, MCG116991, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssx9Q6XAS3 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ssx9Q6XAS3 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ssx9Q6XAS3 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ssx9Q6XAS3 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ssx9Q6XAS3 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ssx9Q6XAS3 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ssx9Q6XAS3 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ssx9Q6XAS3 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ssx9Q6XAS3 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ssx9Q6XAS3 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ssx9Q6XAS3 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ssx9Q6XAS3 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ssx9Q6XAS3 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ssx9Q6XAS3 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ssx9Q6XAS3 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ssx9Q6XAS3 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ssx9Q6XAS3 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ssx9Q6XAS3 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ssx9Q6XAS3 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ssx9Q6XAS3 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ssx9Q6XAS3 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ssx9Q6XAS3 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ssx9Q6XAS3 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ssx9Q6XAS3 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ssx9Q6XAS3 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ssx9Q6XAS3 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ssx9Q6XAS3 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ssx9Q6XAS3 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ssx9Q6XAS3 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ssx9Q6XAS3 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ssx9Q6XAS3 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ssx9Q6XAS3 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ssx9Q6XAS3 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ssx9Q6XAS3 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ssx9Q6XAS3 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ssx9Q6XAS3 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ssx9Q6XAS3 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ssx9Q6XAS3 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Ssx9Q6XAS3 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ssx9Q6XAS3 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ssx9Q6XAS3 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ssx9Q6XAS3 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ssx9Q6XAS3 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ssx9Q6XAS3 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ssx9Q6XAS3 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ssx9Q6XAS3 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ssx9Q6XAS3 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Ssx9Q6XAS3 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Ssx9Q6XAS3 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Ssx9Q6XAS3 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Ssx9Q6XAS3 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ssx9Q6XAS3 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Ssx9Q6XAS3 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Ssx9Q6XAS3 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ssx9Q6XAS3 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ssx9Q6XAS3 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ssx9Q6XAS3 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ssx9Q6XAS3 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ssx9Q6XAS3 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ssx9Q6XAS3 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ssx9Q6XAS3 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ssx9Q6XAS3 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ssx9Q6XAS3 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ssx9Q6XAS3 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ssx9Q6XAS3 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ssx9Q6XAS3 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ssx9Q6XAS3 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ssx9Q6XAS3 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ssx9Q6XAS3 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ssx9Q6XAS3 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ssx9Q6XAS3 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ssx9Q6XAS3 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ssx9Q6XAS3 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ssx9Q6XAS3 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ssx9Q6XAS3 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ssx9Q6XAS3 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ssx9Q6XAS3 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ssx9Q6XAS3 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ssx9Q6XAS3 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ssx9Q6XAS3 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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