Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHS6

Snx13, Sorting nexin-13, mousemouse

Predictions only

Length 957 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx13Q6PHS6 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx13Q6PHS6 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx13Q6PHS6 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx13Q6PHS6 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx13Q6PHS6 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx13Q6PHS6 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx13Q6PHS6 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx13Q6PHS6 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx13Q6PHS6 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx13Q6PHS6 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx13Q6PHS6 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx13Q6PHS6 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx13Q6PHS6 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx13Q6PHS6 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx13Q6PHS6 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx13Q6PHS6 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx13Q6PHS6 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx13Q6PHS6 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx13Q6PHS6 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx13Q6PHS6 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx13Q6PHS6 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx13Q6PHS6 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx13Q6PHS6 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx13Q6PHS6 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx13Q6PHS6 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx13Q6PHS6 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx13Q6PHS6 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx13Q6PHS6 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx13Q6PHS6 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx13Q6PHS6 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx13Q6PHS6 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx13Q6PHS6 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx13Q6PHS6 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx13Q6PHS6 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx13Q6PHS6 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx13Q6PHS6 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx13Q6PHS6 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx13Q6PHS6 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx13Q6PHS6 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx13Q6PHS6 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx13Q6PHS6 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx13Q6PHS6 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx13Q6PHS6 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx13Q6PHS6 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx13Q6PHS6 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx13Q6PHS6 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx13Q6PHS6 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx13Q6PHS6 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx13Q6PHS6 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx13Q6PHS6 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx13Q6PHS6 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx13Q6PHS6 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx13Q6PHS6 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx13Q6PHS6 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx13Q6PHS6 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx13Q6PHS6 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx13Q6PHS6 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx13Q6PHS6 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx13Q6PHS6 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx13Q6PHS6 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx13Q6PHS6 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx13Q6PHS6 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx13Q6PHS6 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx13Q6PHS6 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx13Q6PHS6 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx13Q6PHS6 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx13Q6PHS6 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx13Q6PHS6 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx13Q6PHS6 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx13Q6PHS6 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx13Q6PHS6 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx13Q6PHS6 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx13Q6PHS6 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx13Q6PHS6 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx13Q6PHS6 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx13Q6PHS6 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx13Q6PHS6 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx13Q6PHS6 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx13Q6PHS6 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx13Q6PHS6 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx13Q6PHS6 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx13Q6PHS6 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx13Q6PHS6 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx13Q6PHS6 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx13Q6PHS6 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx13Q6PHS6 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx13Q6PHS6 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx13Q6PHS6 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx13Q6PHS6 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx13Q6PHS6 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx13Q6PHS6 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx13Q6PHS6 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx13Q6PHS6 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx13Q6PHS6 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx13Q6PHS6 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx13Q6PHS6 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx13Q6PHS6 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx13Q6PHS6 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx13Q6PHS6 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx13Q6PHS6 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms