Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE7

Tmeff1, Tomoregulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff1Q6PFE7 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmeff1Q6PFE7 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmeff1Q6PFE7 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmeff1Q6PFE7 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmeff1Q6PFE7 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmeff1Q6PFE7 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmeff1Q6PFE7 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmeff1Q6PFE7 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmeff1Q6PFE7 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmeff1Q6PFE7 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmeff1Q6PFE7 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmeff1Q6PFE7 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmeff1Q6PFE7 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmeff1Q6PFE7 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmeff1Q6PFE7 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmeff1Q6PFE7 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmeff1Q6PFE7 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmeff1Q6PFE7 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmeff1Q6PFE7 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Tmeff1Q6PFE7 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmeff1Q6PFE7 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmeff1Q6PFE7 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmeff1Q6PFE7 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmeff1Q6PFE7 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmeff1Q6PFE7 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmeff1Q6PFE7 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmeff1Q6PFE7 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Tmeff1Q6PFE7 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmeff1Q6PFE7 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmeff1Q6PFE7 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmeff1Q6PFE7 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Tmeff1Q6PFE7 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmeff1Q6PFE7 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmeff1Q6PFE7 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmeff1Q6PFE7 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Tmeff1Q6PFE7 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmeff1Q6PFE7 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Tmeff1Q6PFE7 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmeff1Q6PFE7 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Tmeff1Q6PFE7 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmeff1Q6PFE7 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmeff1Q6PFE7 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmeff1Q6PFE7 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmeff1Q6PFE7 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmeff1Q6PFE7 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmeff1Q6PFE7 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Tmeff1Q6PFE7 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms