Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4U0

Thsd7b, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 7B, mousemouse

Predictions only

Length 1,607 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thsd7bQ6P4U0 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Thsd7bQ6P4U0 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Thsd7bQ6P4U0 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
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Thsd7bQ6P4U0 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Thsd7bQ6P4U0 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Thsd7bQ6P4U0 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Thsd7bQ6P4U0 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Thsd7bQ6P4U0 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Thsd7bQ6P4U0 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Thsd7bQ6P4U0 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Thsd7bQ6P4U0 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Thsd7bQ6P4U0 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Thsd7bQ6P4U0 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Thsd7bQ6P4U0 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Thsd7bQ6P4U0 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Thsd7bQ6P4U0 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Thsd7bQ6P4U0 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
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Thsd7bQ6P4U0 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Thsd7bQ6P4U0 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Thsd7bQ6P4U0 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Thsd7bQ6P4U0 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Thsd7bQ6P4U0 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Thsd7bQ6P4U0 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Thsd7bQ6P4U0 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Thsd7bQ6P4U0 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Thsd7bQ6P4U0 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Thsd7bQ6P4U0 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Thsd7bQ6P4U0 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Thsd7bQ6P4U0 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Thsd7bQ6P4U0 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Thsd7bQ6P4U0 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Thsd7bQ6P4U0 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Thsd7bQ6P4U0 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Thsd7bQ6P4U0 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Thsd7bQ6P4U0 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Thsd7bQ6P4U0 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Thsd7bQ6P4U0 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Thsd7bQ6P4U0 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Thsd7bQ6P4U0 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Thsd7bQ6P4U0 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Thsd7bQ6P4U0 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Thsd7bQ6P4U0 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Thsd7bQ6P4U0 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Thsd7bQ6P4U0 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Thsd7bQ6P4U0 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Thsd7bQ6P4U0 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Thsd7bQ6P4U0 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Thsd7bQ6P4U0 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Thsd7bQ6P4U0 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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