Protein–RNA interactions for Protein: Q6DID3

Scaf8, Protein SCAF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf8Q6DID3 Gm16973-201ENSMUST00000180682 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Scaf8Q6DID3 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Scaf8Q6DID3 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Scaf8Q6DID3 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Scaf8Q6DID3 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Scaf8Q6DID3 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Scaf8Q6DID3 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Scaf8Q6DID3 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scaf8Q6DID3 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scaf8Q6DID3 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scaf8Q6DID3 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scaf8Q6DID3 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scaf8Q6DID3 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scaf8Q6DID3 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scaf8Q6DID3 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scaf8Q6DID3 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Scaf8Q6DID3 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scaf8Q6DID3 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scaf8Q6DID3 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scaf8Q6DID3 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Scaf8Q6DID3 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scaf8Q6DID3 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Scaf8Q6DID3 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scaf8Q6DID3 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms