Protein–RNA interactions for Protein: Q64448

Gja3, Gap junction alpha-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja3Q64448 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gja3Q64448 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gja3Q64448 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gja3Q64448 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gja3Q64448 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gja3Q64448 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gja3Q64448 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gja3Q64448 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gja3Q64448 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gja3Q64448 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gja3Q64448 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gja3Q64448 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gja3Q64448 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gja3Q64448 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gja3Q64448 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gja3Q64448 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gja3Q64448 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gja3Q64448 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gja3Q64448 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gja3Q64448 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gja3Q64448 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gja3Q64448 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gja3Q64448 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gja3Q64448 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gja3Q64448 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gja3Q64448 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gja3Q64448 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gja3Q64448 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gja3Q64448 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gja3Q64448 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gja3Q64448 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gja3Q64448 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gja3Q64448 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gja3Q64448 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gja3Q64448 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gja3Q64448 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gja3Q64448 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gja3Q64448 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gja3Q64448 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gja3Q64448 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gja3Q64448 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gja3Q64448 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gja3Q64448 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gja3Q64448 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gja3Q64448 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gja3Q64448 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gja3Q64448 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gja3Q64448 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gja3Q64448 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gja3Q64448 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gja3Q64448 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gja3Q64448 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gja3Q64448 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gja3Q64448 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gja3Q64448 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gja3Q64448 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gja3Q64448 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gja3Q64448 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gja3Q64448 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gja3Q64448 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gja3Q64448 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gja3Q64448 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gja3Q64448 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gja3Q64448 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gja3Q64448 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gja3Q64448 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gja3Q64448 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gja3Q64448 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gja3Q64448 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gja3Q64448 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gja3Q64448 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gja3Q64448 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gja3Q64448 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gja3Q64448 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gja3Q64448 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gja3Q64448 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gja3Q64448 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gja3Q64448 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gja3Q64448 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gja3Q64448 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gja3Q64448 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gja3Q64448 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gja3Q64448 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gja3Q64448 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gja3Q64448 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gja3Q64448 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gja3Q64448 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gja3Q64448 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gja3Q64448 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gja3Q64448 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gja3Q64448 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gja3Q64448 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gja3Q64448 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gja3Q64448 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gja3Q64448 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gja3Q64448 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gja3Q64448 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gja3Q64448 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gja3Q64448 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gja3Q64448 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms