Protein–RNA interactions for Protein: Q60867

Neurod1, Neurogenic differentiation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurod1Q60867 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Neurod1Q60867 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Neurod1Q60867 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Neurod1Q60867 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Neurod1Q60867 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Neurod1Q60867 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Neurod1Q60867 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Neurod1Q60867 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Neurod1Q60867 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Neurod1Q60867 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Neurod1Q60867 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Neurod1Q60867 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Neurod1Q60867 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Neurod1Q60867 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Neurod1Q60867 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Neurod1Q60867 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Neurod1Q60867 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Neurod1Q60867 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Neurod1Q60867 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Neurod1Q60867 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Neurod1Q60867 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Neurod1Q60867 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Neurod1Q60867 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Neurod1Q60867 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Neurod1Q60867 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Neurod1Q60867 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Neurod1Q60867 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Neurod1Q60867 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Neurod1Q60867 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Neurod1Q60867 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Neurod1Q60867 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Neurod1Q60867 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Neurod1Q60867 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Neurod1Q60867 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Neurod1Q60867 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Neurod1Q60867 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Neurod1Q60867 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Neurod1Q60867 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Neurod1Q60867 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Neurod1Q60867 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Neurod1Q60867 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Neurod1Q60867 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Neurod1Q60867 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Neurod1Q60867 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Neurod1Q60867 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Neurod1Q60867 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Neurod1Q60867 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Neurod1Q60867 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Neurod1Q60867 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Neurod1Q60867 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Neurod1Q60867 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Neurod1Q60867 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Neurod1Q60867 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Neurod1Q60867 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Neurod1Q60867 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Neurod1Q60867 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Neurod1Q60867 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Neurod1Q60867 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Neurod1Q60867 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Neurod1Q60867 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Neurod1Q60867 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Neurod1Q60867 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Neurod1Q60867 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Neurod1Q60867 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Neurod1Q60867 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Neurod1Q60867 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Neurod1Q60867 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Neurod1Q60867 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Neurod1Q60867 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Neurod1Q60867 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Neurod1Q60867 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Neurod1Q60867 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Neurod1Q60867 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Neurod1Q60867 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Neurod1Q60867 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Neurod1Q60867 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Neurod1Q60867 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Neurod1Q60867 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Neurod1Q60867 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Neurod1Q60867 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Neurod1Q60867 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Neurod1Q60867 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Neurod1Q60867 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Neurod1Q60867 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Neurod1Q60867 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Neurod1Q60867 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Neurod1Q60867 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Neurod1Q60867 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Neurod1Q60867 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Neurod1Q60867 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Neurod1Q60867 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Neurod1Q60867 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Neurod1Q60867 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Neurod1Q60867 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Neurod1Q60867 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Neurod1Q60867 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Neurod1Q60867 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Neurod1Q60867 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Neurod1Q60867 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Neurod1Q60867 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.3 ms