Protein–RNA interactions for Protein: Q60722

Tcf4, Transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf4Q60722 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tcf4Q60722 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tcf4Q60722 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tcf4Q60722 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tcf4Q60722 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tcf4Q60722 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tcf4Q60722 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tcf4Q60722 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tcf4Q60722 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tcf4Q60722 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tcf4Q60722 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tcf4Q60722 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tcf4Q60722 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tcf4Q60722 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tcf4Q60722 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tcf4Q60722 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tcf4Q60722 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tcf4Q60722 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tcf4Q60722 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tcf4Q60722 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tcf4Q60722 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tcf4Q60722 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tcf4Q60722 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tcf4Q60722 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tcf4Q60722 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tcf4Q60722 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tcf4Q60722 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tcf4Q60722 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tcf4Q60722 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Tcf4Q60722 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tcf4Q60722 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tcf4Q60722 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tcf4Q60722 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tcf4Q60722 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tcf4Q60722 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tcf4Q60722 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tcf4Q60722 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tcf4Q60722 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tcf4Q60722 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tcf4Q60722 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tcf4Q60722 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tcf4Q60722 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tcf4Q60722 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tcf4Q60722 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tcf4Q60722 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tcf4Q60722 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tcf4Q60722 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tcf4Q60722 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tcf4Q60722 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tcf4Q60722 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Tcf4Q60722 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Tcf4Q60722 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tcf4Q60722 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tcf4Q60722 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tcf4Q60722 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tcf4Q60722 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Tcf4Q60722 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Tcf4Q60722 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tcf4Q60722 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tcf4Q60722 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tcf4Q60722 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Tcf4Q60722 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tcf4Q60722 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tcf4Q60722 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Tcf4Q60722 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tcf4Q60722 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tcf4Q60722 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tcf4Q60722 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tcf4Q60722 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tcf4Q60722 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tcf4Q60722 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tcf4Q60722 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Tcf4Q60722 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
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