Protein–RNA interactions for Protein: Q60665

Skil, Ski-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 675 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SkilQ60665 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SkilQ60665 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SkilQ60665 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SkilQ60665 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SkilQ60665 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SkilQ60665 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SkilQ60665 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SkilQ60665 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SkilQ60665 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SkilQ60665 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SkilQ60665 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SkilQ60665 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SkilQ60665 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SkilQ60665 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SkilQ60665 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SkilQ60665 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SkilQ60665 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SkilQ60665 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SkilQ60665 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SkilQ60665 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SkilQ60665 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SkilQ60665 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SkilQ60665 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SkilQ60665 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SkilQ60665 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SkilQ60665 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SkilQ60665 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SkilQ60665 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SkilQ60665 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SkilQ60665 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SkilQ60665 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SkilQ60665 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SkilQ60665 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SkilQ60665 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SkilQ60665 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SkilQ60665 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SkilQ60665 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SkilQ60665 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SkilQ60665 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SkilQ60665 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SkilQ60665 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SkilQ60665 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SkilQ60665 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SkilQ60665 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SkilQ60665 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SkilQ60665 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SkilQ60665 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SkilQ60665 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SkilQ60665 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SkilQ60665 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SkilQ60665 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SkilQ60665 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SkilQ60665 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SkilQ60665 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SkilQ60665 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SkilQ60665 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SkilQ60665 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SkilQ60665 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SkilQ60665 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SkilQ60665 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SkilQ60665 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SkilQ60665 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SkilQ60665 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SkilQ60665 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SkilQ60665 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SkilQ60665 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SkilQ60665 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SkilQ60665 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SkilQ60665 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SkilQ60665 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SkilQ60665 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SkilQ60665 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SkilQ60665 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SkilQ60665 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SkilQ60665 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SkilQ60665 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SkilQ60665 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SkilQ60665 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SkilQ60665 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SkilQ60665 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SkilQ60665 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SkilQ60665 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SkilQ60665 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SkilQ60665 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SkilQ60665 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SkilQ60665 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SkilQ60665 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SkilQ60665 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SkilQ60665 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SkilQ60665 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SkilQ60665 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SkilQ60665 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SkilQ60665 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SkilQ60665 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SkilQ60665 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SkilQ60665 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SkilQ60665 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SkilQ60665 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SkilQ60665 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SkilQ60665 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms