Protein–RNA interactions for Protein: Q5SX40

Myh1, Myosin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,942 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myh1Q5SX40 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Myh1Q5SX40 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Myh1Q5SX40 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Myh1Q5SX40 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Myh1Q5SX40 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Myh1Q5SX40 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Myh1Q5SX40 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Myh1Q5SX40 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Myh1Q5SX40 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Myh1Q5SX40 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Myh1Q5SX40 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Myh1Q5SX40 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Myh1Q5SX40 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Myh1Q5SX40 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Myh1Q5SX40 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Myh1Q5SX40 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Myh1Q5SX40 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Myh1Q5SX40 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Myh1Q5SX40 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Myh1Q5SX40 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Myh1Q5SX40 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Myh1Q5SX40 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Myh1Q5SX40 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Myh1Q5SX40 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Myh1Q5SX40 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Myh1Q5SX40 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Myh1Q5SX40 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Myh1Q5SX40 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Myh1Q5SX40 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Myh1Q5SX40 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Myh1Q5SX40 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Myh1Q5SX40 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Myh1Q5SX40 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Myh1Q5SX40 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Myh1Q5SX40 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Myh1Q5SX40 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Myh1Q5SX40 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Myh1Q5SX40 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Myh1Q5SX40 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Myh1Q5SX40 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Myh1Q5SX40 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Myh1Q5SX40 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Myh1Q5SX40 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Myh1Q5SX40 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Myh1Q5SX40 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Myh1Q5SX40 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Myh1Q5SX40 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Myh1Q5SX40 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Myh1Q5SX40 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Myh1Q5SX40 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Myh1Q5SX40 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Myh1Q5SX40 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Myh1Q5SX40 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Myh1Q5SX40 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Myh1Q5SX40 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Myh1Q5SX40 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Myh1Q5SX40 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Myh1Q5SX40 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Myh1Q5SX40 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Myh1Q5SX40 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Myh1Q5SX40 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Myh1Q5SX40 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Myh1Q5SX40 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Myh1Q5SX40 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Myh1Q5SX40 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Myh1Q5SX40 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Myh1Q5SX40 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Myh1Q5SX40 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Myh1Q5SX40 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Myh1Q5SX40 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Myh1Q5SX40 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Myh1Q5SX40 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Myh1Q5SX40 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Myh1Q5SX40 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Myh1Q5SX40 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Myh1Q5SX40 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Myh1Q5SX40 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Myh1Q5SX40 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Myh1Q5SX40 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Myh1Q5SX40 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Myh1Q5SX40 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Myh1Q5SX40 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Myh1Q5SX40 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Myh1Q5SX40 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Myh1Q5SX40 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Myh1Q5SX40 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Myh1Q5SX40 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Myh1Q5SX40 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Myh1Q5SX40 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Myh1Q5SX40 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Myh1Q5SX40 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Myh1Q5SX40 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Myh1Q5SX40 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Myh1Q5SX40 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Myh1Q5SX40 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Myh1Q5SX40 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Myh1Q5SX40 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Myh1Q5SX40 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Myh1Q5SX40 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Myh1Q5SX40 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms