Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Sft2d1Q5SSN7 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms