Protein–RNA interactions for Protein: Q4FK66

Prpf38a, Pre-mRNA-splicing factor 38A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf38aQ4FK66 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prpf38aQ4FK66 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prpf38aQ4FK66 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prpf38aQ4FK66 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prpf38aQ4FK66 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prpf38aQ4FK66 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prpf38aQ4FK66 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prpf38aQ4FK66 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prpf38aQ4FK66 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prpf38aQ4FK66 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prpf38aQ4FK66 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prpf38aQ4FK66 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Prpf38aQ4FK66 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prpf38aQ4FK66 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prpf38aQ4FK66 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prpf38aQ4FK66 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prpf38aQ4FK66 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Prpf38aQ4FK66 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prpf38aQ4FK66 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prpf38aQ4FK66 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prpf38aQ4FK66 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prpf38aQ4FK66 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prpf38aQ4FK66 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Prpf38aQ4FK66 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prpf38aQ4FK66 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prpf38aQ4FK66 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prpf38aQ4FK66 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prpf38aQ4FK66 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prpf38aQ4FK66 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prpf38aQ4FK66 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prpf38aQ4FK66 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prpf38aQ4FK66 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prpf38aQ4FK66 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prpf38aQ4FK66 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prpf38aQ4FK66 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prpf38aQ4FK66 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prpf38aQ4FK66 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prpf38aQ4FK66 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prpf38aQ4FK66 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prpf38aQ4FK66 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prpf38aQ4FK66 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Prpf38aQ4FK66 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Prpf38aQ4FK66 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prpf38aQ4FK66 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prpf38aQ4FK66 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prpf38aQ4FK66 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prpf38aQ4FK66 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prpf38aQ4FK66 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prpf38aQ4FK66 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prpf38aQ4FK66 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prpf38aQ4FK66 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prpf38aQ4FK66 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prpf38aQ4FK66 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prpf38aQ4FK66 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prpf38aQ4FK66 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prpf38aQ4FK66 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prpf38aQ4FK66 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prpf38aQ4FK66 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prpf38aQ4FK66 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prpf38aQ4FK66 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prpf38aQ4FK66 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prpf38aQ4FK66 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prpf38aQ4FK66 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prpf38aQ4FK66 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prpf38aQ4FK66 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Prpf38aQ4FK66 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Prpf38aQ4FK66 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prpf38aQ4FK66 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prpf38aQ4FK66 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prpf38aQ4FK66 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prpf38aQ4FK66 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prpf38aQ4FK66 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prpf38aQ4FK66 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prpf38aQ4FK66 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prpf38aQ4FK66 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prpf38aQ4FK66 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prpf38aQ4FK66 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prpf38aQ4FK66 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prpf38aQ4FK66 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prpf38aQ4FK66 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prpf38aQ4FK66 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prpf38aQ4FK66 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prpf38aQ4FK66 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prpf38aQ4FK66 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prpf38aQ4FK66 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prpf38aQ4FK66 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prpf38aQ4FK66 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prpf38aQ4FK66 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prpf38aQ4FK66 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prpf38aQ4FK66 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prpf38aQ4FK66 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prpf38aQ4FK66 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Prpf38aQ4FK66 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Prpf38aQ4FK66 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Prpf38aQ4FK66 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prpf38aQ4FK66 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prpf38aQ4FK66 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prpf38aQ4FK66 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prpf38aQ4FK66 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Prpf38aQ4FK66 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms