Protein–RNA interactions for Protein: Q45VN2

Defa20, Alpha-defensin 20, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa20Q45VN2 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 Slc1a2-202ENSMUST00000080210 11595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 Smchd1-201ENSMUST00000127430 7052 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms