Protein–RNA interactions for Protein: Q3V129

Ulk4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, mousemouse

Predictions only

Length 1,303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk4Q3V129 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ulk4Q3V129 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms