Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samd11Q1RNF8 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samd11Q1RNF8 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samd11Q1RNF8 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samd11Q1RNF8 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samd11Q1RNF8 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samd11Q1RNF8 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samd11Q1RNF8 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samd11Q1RNF8 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samd11Q1RNF8 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samd11Q1RNF8 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samd11Q1RNF8 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samd11Q1RNF8 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samd11Q1RNF8 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samd11Q1RNF8 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Samd11Q1RNF8 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samd11Q1RNF8 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samd11Q1RNF8 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samd11Q1RNF8 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Samd11Q1RNF8 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samd11Q1RNF8 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samd11Q1RNF8 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samd11Q1RNF8 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samd11Q1RNF8 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Samd11Q1RNF8 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samd11Q1RNF8 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samd11Q1RNF8 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Samd11Q1RNF8 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samd11Q1RNF8 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samd11Q1RNF8 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samd11Q1RNF8 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samd11Q1RNF8 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samd11Q1RNF8 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samd11Q1RNF8 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samd11Q1RNF8 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samd11Q1RNF8 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samd11Q1RNF8 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samd11Q1RNF8 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samd11Q1RNF8 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Samd11Q1RNF8 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samd11Q1RNF8 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samd11Q1RNF8 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samd11Q1RNF8 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samd11Q1RNF8 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samd11Q1RNF8 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Samd11Q1RNF8 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samd11Q1RNF8 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samd11Q1RNF8 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samd11Q1RNF8 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samd11Q1RNF8 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samd11Q1RNF8 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samd11Q1RNF8 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samd11Q1RNF8 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Samd11Q1RNF8 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samd11Q1RNF8 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samd11Q1RNF8 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Samd11Q1RNF8 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Samd11Q1RNF8 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Samd11Q1RNF8 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Samd11Q1RNF8 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Samd11Q1RNF8 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Samd11Q1RNF8 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Samd11Q1RNF8 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Samd11Q1RNF8 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Samd11Q1RNF8 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Samd11Q1RNF8 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Samd11Q1RNF8 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Samd11Q1RNF8 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Samd11Q1RNF8 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Samd11Q1RNF8 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Samd11Q1RNF8 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Samd11Q1RNF8 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Samd11Q1RNF8 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Samd11Q1RNF8 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Samd11Q1RNF8 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Samd11Q1RNF8 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.4 ms