Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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ptchd1Q14B62 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ptchd1Q14B62 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ptchd1Q14B62 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ptchd1Q14B62 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ptchd1Q14B62 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ptchd1Q14B62 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ptchd1Q14B62 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ptchd1Q14B62 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ptchd1Q14B62 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ptchd1Q14B62 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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ptchd1Q14B62 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ptchd1Q14B62 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ptchd1Q14B62 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ptchd1Q14B62 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ptchd1Q14B62 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ptchd1Q14B62 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ptchd1Q14B62 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ptchd1Q14B62 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ptchd1Q14B62 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ptchd1Q14B62 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ptchd1Q14B62 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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ptchd1Q14B62 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ptchd1Q14B62 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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ptchd1Q14B62 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ptchd1Q14B62 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ptchd1Q14B62 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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ptchd1Q14B62 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ptchd1Q14B62 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ptchd1Q14B62 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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ptchd1Q14B62 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ptchd1Q14B62 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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ptchd1Q14B62 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ptchd1Q14B62 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ptchd1Q14B62 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ptchd1Q14B62 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ptchd1Q14B62 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ptchd1Q14B62 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ptchd1Q14B62 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ptchd1Q14B62 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ptchd1Q14B62 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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