Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Itgb8Q0VBD0 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Itgb8Q0VBD0 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Itgb8Q0VBD0 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Itgb8Q0VBD0 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Itgb8Q0VBD0 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Itgb8Q0VBD0 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Itgb8Q0VBD0 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Itgb8Q0VBD0 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Itgb8Q0VBD0 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Itgb8Q0VBD0 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms