Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Znf541Q0GGX2 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms