Protein–RNA interactions for Protein: Q08423

Tff1, Trefoil factor 1, mousemouse

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Length 87 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff1Q08423 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Tff1Q08423 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Tff1Q08423 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Tff1Q08423 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Tff1Q08423 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Tff1Q08423 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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