Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Msx2Q03358 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms