Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cacna1sQ02789 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cacna1sQ02789 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cacna1sQ02789 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cacna1sQ02789 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cacna1sQ02789 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cacna1sQ02789 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cacna1sQ02789 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacna1sQ02789 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacna1sQ02789 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacna1sQ02789 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacna1sQ02789 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacna1sQ02789 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacna1sQ02789 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacna1sQ02789 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacna1sQ02789 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacna1sQ02789 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacna1sQ02789 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacna1sQ02789 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacna1sQ02789 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacna1sQ02789 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacna1sQ02789 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacna1sQ02789 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacna1sQ02789 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacna1sQ02789 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacna1sQ02789 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacna1sQ02789 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacna1sQ02789 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacna1sQ02789 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacna1sQ02789 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacna1sQ02789 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacna1sQ02789 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacna1sQ02789 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cacna1sQ02789 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cacna1sQ02789 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cacna1sQ02789 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cacna1sQ02789 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cacna1sQ02789 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cacna1sQ02789 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Cacna1sQ02789 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cacna1sQ02789 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cacna1sQ02789 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cacna1sQ02789 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cacna1sQ02789 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Cacna1sQ02789 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.1 ms