Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SeleQ00690 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SeleQ00690 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SeleQ00690 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SeleQ00690 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SeleQ00690 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SeleQ00690 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SeleQ00690 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SeleQ00690 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SeleQ00690 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SeleQ00690 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms