Protein–RNA interactions for Protein: P97452

Bop1, Ribosome biogenesis protein BOP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bop1P97452 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Bop1P97452 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Bop1P97452 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Bop1P97452 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Bop1P97452 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Bop1P97452 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Bop1P97452 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Bop1P97452 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Bop1P97452 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Bop1P97452 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Bop1P97452 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms