Protein–RNA interactions for Protein: P97351

Rps3a, 40S ribosomal protein S3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3aP97351 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Rps3aP97351 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rps3aP97351 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rps3aP97351 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rps3aP97351 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rps3aP97351 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rps3aP97351 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rps3aP97351 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rps3aP97351 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rps3aP97351 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rps3aP97351 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rps3aP97351 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rps3aP97351 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rps3aP97351 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rps3aP97351 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rps3aP97351 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rps3aP97351 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rps3aP97351 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rps3aP97351 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rps3aP97351 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rps3aP97351 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rps3aP97351 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rps3aP97351 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rps3aP97351 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rps3aP97351 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rps3aP97351 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rps3aP97351 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rps3aP97351 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Rps3aP97351 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rps3aP97351 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rps3aP97351 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rps3aP97351 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rps3aP97351 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rps3aP97351 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rps3aP97351 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rps3aP97351 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rps3aP97351 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rps3aP97351 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rps3aP97351 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rps3aP97351 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rps3aP97351 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rps3aP97351 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rps3aP97351 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rps3aP97351 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rps3aP97351 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Rps3aP97351 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rps3aP97351 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rps3aP97351 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rps3aP97351 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Rps3aP97351 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rps3aP97351 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rps3aP97351 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rps3aP97351 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rps3aP97351 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rps3aP97351 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rps3aP97351 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rps3aP97351 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rps3aP97351 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Rps3aP97351 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rps3aP97351 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rps3aP97351 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rps3aP97351 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Rps3aP97351 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rps3aP97351 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rps3aP97351 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rps3aP97351 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rps3aP97351 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rps3aP97351 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rps3aP97351 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rps3aP97351 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rps3aP97351 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rps3aP97351 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rps3aP97351 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rps3aP97351 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rps3aP97351 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rps3aP97351 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rps3aP97351 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rps3aP97351 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rps3aP97351 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rps3aP97351 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rps3aP97351 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rps3aP97351 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Rps3aP97351 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rps3aP97351 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rps3aP97351 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rps3aP97351 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rps3aP97351 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rps3aP97351 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rps3aP97351 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rps3aP97351 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rps3aP97351 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rps3aP97351 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rps3aP97351 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rps3aP97351 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rps3aP97351 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rps3aP97351 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rps3aP97351 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rps3aP97351 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rps3aP97351 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rps3aP97351 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms