Protein–RNA interactions for Protein: P82976

Gbx1, Homeobox protein GBX-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx1P82976 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gbx1P82976 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gbx1P82976 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gbx1P82976 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gbx1P82976 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gbx1P82976 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gbx1P82976 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gbx1P82976 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gbx1P82976 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gbx1P82976 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gbx1P82976 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Gbx1P82976 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gbx1P82976 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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