Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Irx2P81066 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Irx2P81066 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Irx2P81066 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Irx2P81066 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Irx2P81066 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Irx2P81066 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Irx2P81066 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Irx2P81066 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Irx2P81066 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Irx2P81066 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Irx2P81066 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Irx2P81066 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Irx2P81066 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Irx2P81066 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Irx2P81066 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Irx2P81066 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Irx2P81066 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Irx2P81066 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Irx2P81066 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Irx2P81066 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Irx2P81066 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Irx2P81066 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Irx2P81066 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Irx2P81066 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Irx2P81066 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Irx2P81066 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Irx2P81066 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Irx2P81066 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Irx2P81066 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Irx2P81066 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Irx2P81066 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Irx2P81066 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Irx2P81066 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Irx2P81066 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Irx2P81066 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Irx2P81066 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Irx2P81066 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Irx2P81066 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Irx2P81066 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Irx2P81066 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Irx2P81066 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Irx2P81066 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Irx2P81066 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Irx2P81066 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Irx2P81066 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
Irx2P81066 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Irx2P81066 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Irx2P81066 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Irx2P81066 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Irx2P81066 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Irx2P81066 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Irx2P81066 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Irx2P81066 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Irx2P81066 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Irx2P81066 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Irx2P81066 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Irx2P81066 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Irx2P81066 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Irx2P81066 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Irx2P81066 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Irx2P81066 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Irx2P81066 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Irx2P81066 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Irx2P81066 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Irx2P81066 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Irx2P81066 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Irx2P81066 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Irx2P81066 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Irx2P81066 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Irx2P81066 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Irx2P81066 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Irx2P81066 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Irx2P81066 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Irx2P81066 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Irx2P81066 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Irx2P81066 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Irx2P81066 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Irx2P81066 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Irx2P81066 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Irx2P81066 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Irx2P81066 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Irx2P81066 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Irx2P81066 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Irx2P81066 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Irx2P81066 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Irx2P81066 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Irx2P81066 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Irx2P81066 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Irx2P81066 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Irx2P81066 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Irx2P81066 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Irx2P81066 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Irx2P81066 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Irx2P81066 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Irx2P81066 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Irx2P81066 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Irx2P81066 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Irx2P81066 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Irx2P81066 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms