Protein–RNA interactions for Protein: P79621

Ciita, MHC class II transactivator, mousemouse

Predictions only

Length 1,155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CiitaP79621 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CiitaP79621 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CiitaP79621 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CiitaP79621 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CiitaP79621 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CiitaP79621 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CiitaP79621 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CiitaP79621 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CiitaP79621 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CiitaP79621 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CiitaP79621 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CiitaP79621 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CiitaP79621 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CiitaP79621 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CiitaP79621 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CiitaP79621 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CiitaP79621 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CiitaP79621 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CiitaP79621 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CiitaP79621 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CiitaP79621 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CiitaP79621 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CiitaP79621 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CiitaP79621 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CiitaP79621 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CiitaP79621 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CiitaP79621 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CiitaP79621 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CiitaP79621 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CiitaP79621 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CiitaP79621 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CiitaP79621 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CiitaP79621 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CiitaP79621 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CiitaP79621 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CiitaP79621 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CiitaP79621 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CiitaP79621 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CiitaP79621 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CiitaP79621 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CiitaP79621 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CiitaP79621 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CiitaP79621 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CiitaP79621 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CiitaP79621 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CiitaP79621 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CiitaP79621 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CiitaP79621 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CiitaP79621 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CiitaP79621 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CiitaP79621 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CiitaP79621 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CiitaP79621 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CiitaP79621 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CiitaP79621 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CiitaP79621 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CiitaP79621 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CiitaP79621 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CiitaP79621 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CiitaP79621 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CiitaP79621 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
CiitaP79621 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CiitaP79621 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CiitaP79621 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CiitaP79621 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CiitaP79621 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CiitaP79621 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CiitaP79621 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CiitaP79621 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CiitaP79621 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CiitaP79621 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CiitaP79621 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CiitaP79621 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CiitaP79621 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CiitaP79621 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CiitaP79621 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CiitaP79621 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CiitaP79621 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CiitaP79621 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CiitaP79621 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CiitaP79621 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CiitaP79621 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CiitaP79621 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CiitaP79621 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CiitaP79621 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CiitaP79621 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CiitaP79621 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CiitaP79621 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CiitaP79621 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CiitaP79621 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CiitaP79621 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CiitaP79621 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CiitaP79621 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CiitaP79621 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CiitaP79621 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CiitaP79621 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CiitaP79621 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CiitaP79621 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CiitaP79621 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CiitaP79621 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms