Protein–RNA interactions for Protein: P70424

Erbb2, Receptor tyrosine-protein kinase erbB-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Erbb2P70424 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Erbb2P70424 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Erbb2P70424 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Erbb2P70424 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Erbb2P70424 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Erbb2P70424 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Erbb2P70424 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Erbb2P70424 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Erbb2P70424 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Erbb2P70424 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Erbb2P70424 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Erbb2P70424 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Erbb2P70424 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Erbb2P70424 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Erbb2P70424 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Erbb2P70424 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Erbb2P70424 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Erbb2P70424 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Erbb2P70424 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Erbb2P70424 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Erbb2P70424 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Erbb2P70424 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Erbb2P70424 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Erbb2P70424 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Erbb2P70424 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Erbb2P70424 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Erbb2P70424 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Erbb2P70424 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Erbb2P70424 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Erbb2P70424 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Erbb2P70424 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Erbb2P70424 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Erbb2P70424 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Erbb2P70424 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Erbb2P70424 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Erbb2P70424 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Erbb2P70424 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Erbb2P70424 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Erbb2P70424 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Erbb2P70424 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Erbb2P70424 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Erbb2P70424 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Erbb2P70424 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Erbb2P70424 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Erbb2P70424 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Erbb2P70424 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Erbb2P70424 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Erbb2P70424 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Erbb2P70424 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Erbb2P70424 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Erbb2P70424 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Erbb2P70424 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Erbb2P70424 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Erbb2P70424 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Erbb2P70424 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Erbb2P70424 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Erbb2P70424 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Erbb2P70424 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Erbb2P70424 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Erbb2P70424 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Erbb2P70424 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Erbb2P70424 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Erbb2P70424 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Erbb2P70424 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Erbb2P70424 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Erbb2P70424 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Erbb2P70424 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Erbb2P70424 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Erbb2P70424 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Erbb2P70424 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Erbb2P70424 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Erbb2P70424 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Erbb2P70424 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Erbb2P70424 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Erbb2P70424 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Erbb2P70424 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Erbb2P70424 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Erbb2P70424 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Erbb2P70424 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Erbb2P70424 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Erbb2P70424 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Erbb2P70424 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Erbb2P70424 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Erbb2P70424 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Erbb2P70424 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Erbb2P70424 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Erbb2P70424 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Erbb2P70424 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Erbb2P70424 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Erbb2P70424 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Erbb2P70424 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Erbb2P70424 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Erbb2P70424 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Erbb2P70424 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Erbb2P70424 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Erbb2P70424 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Erbb2P70424 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Erbb2P70424 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Erbb2P70424 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Erbb2P70424 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms