Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Usp9xP70398 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Usp9xP70398 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Usp9xP70398 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Usp9xP70398 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Usp9xP70398 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Usp9xP70398 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Usp9xP70398 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Usp9xP70398 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Usp9xP70398 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Usp9xP70398 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Usp9xP70398 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Usp9xP70398 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Usp9xP70398 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Usp9xP70398 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Usp9xP70398 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Usp9xP70398 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Usp9xP70398 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Usp9xP70398 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Usp9xP70398 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Usp9xP70398 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Usp9xP70398 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Usp9xP70398 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Usp9xP70398 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Usp9xP70398 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Usp9xP70398 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Usp9xP70398 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Usp9xP70398 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Usp9xP70398 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Usp9xP70398 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Usp9xP70398 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Usp9xP70398 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Usp9xP70398 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Usp9xP70398 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Usp9xP70398 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Usp9xP70398 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Usp9xP70398 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp9xP70398 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp9xP70398 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp9xP70398 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp9xP70398 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp9xP70398 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp9xP70398 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp9xP70398 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp9xP70398 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp9xP70398 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp9xP70398 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp9xP70398 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp9xP70398 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp9xP70398 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp9xP70398 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp9xP70398 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp9xP70398 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp9xP70398 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp9xP70398 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp9xP70398 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp9xP70398 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp9xP70398 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp9xP70398 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp9xP70398 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp9xP70398 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp9xP70398 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp9xP70398 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp9xP70398 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp9xP70398 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp9xP70398 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp9xP70398 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp9xP70398 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp9xP70398 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp9xP70398 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp9xP70398 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp9xP70398 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp9xP70398 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp9xP70398 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp9xP70398 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp9xP70398 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp9xP70398 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp9xP70398 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp9xP70398 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp9xP70398 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp9xP70398 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp9xP70398 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp9xP70398 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp9xP70398 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp9xP70398 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp9xP70398 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp9xP70398 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp9xP70398 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp9xP70398 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp9xP70398 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp9xP70398 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp9xP70398 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp9xP70398 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp9xP70398 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp9xP70398 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp9xP70398 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp9xP70398 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp9xP70398 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp9xP70398 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp9xP70398 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
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