Protein–RNA interactions for Protein: P63166

Sumo1, Small ubiquitin-related modifier 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sumo1P63166 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sumo1P63166 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sumo1P63166 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sumo1P63166 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sumo1P63166 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sumo1P63166 Sox5os1-201ENSMUST00000156994 1585 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sumo1P63166 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sumo1P63166 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sumo1P63166 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sumo1P63166 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sumo1P63166 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sumo1P63166 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sumo1P63166 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sumo1P63166 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sumo1P63166 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sumo1P63166 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sumo1P63166 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sumo1P63166 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sumo1P63166 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sumo1P63166 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sumo1P63166 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sumo1P63166 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sumo1P63166 4933403O08Rik-201ENSMUST00000132037 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sumo1P63166 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sumo1P63166 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sumo1P63166 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sumo1P63166 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Sumo1P63166 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Sumo1P63166 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sumo1P63166 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sumo1P63166 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sumo1P63166 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sumo1P63166 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sumo1P63166 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sumo1P63166 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sumo1P63166 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sumo1P63166 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sumo1P63166 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sumo1P63166 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Sumo1P63166 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sumo1P63166 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sumo1P63166 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sumo1P63166 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sumo1P63166 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sumo1P63166 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sumo1P63166 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sumo1P63166 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Sumo1P63166 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Sumo1P63166 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Sumo1P63166 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Sumo1P63166 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Sumo1P63166 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Sumo1P63166 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Sumo1P63166 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Sumo1P63166 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Sumo1P63166 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Sumo1P63166 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Sumo1P63166 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Sumo1P63166 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Sumo1P63166 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Sumo1P63166 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Sumo1P63166 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Sumo1P63166 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Sumo1P63166 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sumo1P63166 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sumo1P63166 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sumo1P63166 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sumo1P63166 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sumo1P63166 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sumo1P63166 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sumo1P63166 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sumo1P63166 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sumo1P63166 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sumo1P63166 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Sumo1P63166 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sumo1P63166 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sumo1P63166 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sumo1P63166 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sumo1P63166 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sumo1P63166 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sumo1P63166 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sumo1P63166 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sumo1P63166 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Sumo1P63166 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sumo1P63166 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sumo1P63166 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sumo1P63166 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sumo1P63166 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sumo1P63166 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sumo1P63166 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sumo1P63166 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sumo1P63166 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sumo1P63166 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sumo1P63166 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sumo1P63166 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sumo1P63166 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sumo1P63166 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sumo1P63166 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sumo1P63166 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sumo1P63166 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms