Protein–RNA interactions for Protein: P62315

Snrpd1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd1P62315 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snrpd1P62315 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snrpd1P62315 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snrpd1P62315 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snrpd1P62315 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snrpd1P62315 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snrpd1P62315 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snrpd1P62315 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snrpd1P62315 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snrpd1P62315 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snrpd1P62315 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snrpd1P62315 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snrpd1P62315 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snrpd1P62315 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snrpd1P62315 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snrpd1P62315 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snrpd1P62315 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snrpd1P62315 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snrpd1P62315 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snrpd1P62315 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snrpd1P62315 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snrpd1P62315 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snrpd1P62315 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snrpd1P62315 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snrpd1P62315 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snrpd1P62315 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snrpd1P62315 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snrpd1P62315 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snrpd1P62315 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snrpd1P62315 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Snrpd1P62315 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snrpd1P62315 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Snrpd1P62315 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snrpd1P62315 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snrpd1P62315 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snrpd1P62315 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snrpd1P62315 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snrpd1P62315 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snrpd1P62315 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snrpd1P62315 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snrpd1P62315 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snrpd1P62315 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Snrpd1P62315 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snrpd1P62315 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snrpd1P62315 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snrpd1P62315 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snrpd1P62315 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snrpd1P62315 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snrpd1P62315 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snrpd1P62315 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snrpd1P62315 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snrpd1P62315 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snrpd1P62315 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snrpd1P62315 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snrpd1P62315 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snrpd1P62315 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snrpd1P62315 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snrpd1P62315 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snrpd1P62315 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snrpd1P62315 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snrpd1P62315 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snrpd1P62315 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snrpd1P62315 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snrpd1P62315 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snrpd1P62315 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snrpd1P62315 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snrpd1P62315 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Snrpd1P62315 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snrpd1P62315 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snrpd1P62315 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snrpd1P62315 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snrpd1P62315 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snrpd1P62315 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snrpd1P62315 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snrpd1P62315 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snrpd1P62315 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snrpd1P62315 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snrpd1P62315 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snrpd1P62315 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snrpd1P62315 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snrpd1P62315 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snrpd1P62315 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snrpd1P62315 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snrpd1P62315 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snrpd1P62315 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snrpd1P62315 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snrpd1P62315 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snrpd1P62315 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snrpd1P62315 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snrpd1P62315 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snrpd1P62315 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snrpd1P62315 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snrpd1P62315 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snrpd1P62315 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snrpd1P62315 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snrpd1P62315 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snrpd1P62315 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snrpd1P62315 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snrpd1P62315 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snrpd1P62315 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms