Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp25P57080 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp25P57080 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp25P57080 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp25P57080 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp25P57080 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp25P57080 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp25P57080 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms