Protein–RNA interactions for Protein: P56960

Exosc10, Exosome component 10, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc10P56960 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Exosc10P56960 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Exosc10P56960 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Exosc10P56960 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Exosc10P56960 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Exosc10P56960 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Exosc10P56960 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Exosc10P56960 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Exosc10P56960 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Exosc10P56960 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Exosc10P56960 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Exosc10P56960 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Exosc10P56960 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Exosc10P56960 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Exosc10P56960 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Exosc10P56960 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Exosc10P56960 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Exosc10P56960 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Exosc10P56960 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Exosc10P56960 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Exosc10P56960 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Exosc10P56960 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Exosc10P56960 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Exosc10P56960 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Exosc10P56960 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Exosc10P56960 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Exosc10P56960 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Exosc10P56960 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Exosc10P56960 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Exosc10P56960 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Exosc10P56960 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Exosc10P56960 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Exosc10P56960 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Exosc10P56960 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Exosc10P56960 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Exosc10P56960 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Exosc10P56960 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Exosc10P56960 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Exosc10P56960 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Exosc10P56960 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Exosc10P56960 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Exosc10P56960 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Exosc10P56960 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Exosc10P56960 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Exosc10P56960 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Exosc10P56960 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Exosc10P56960 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Exosc10P56960 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Exosc10P56960 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Exosc10P56960 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Exosc10P56960 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Exosc10P56960 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Exosc10P56960 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Exosc10P56960 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Exosc10P56960 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Exosc10P56960 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Exosc10P56960 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Exosc10P56960 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Exosc10P56960 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Exosc10P56960 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Exosc10P56960 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Exosc10P56960 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Exosc10P56960 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Exosc10P56960 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Exosc10P56960 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Exosc10P56960 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Exosc10P56960 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Exosc10P56960 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Exosc10P56960 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Exosc10P56960 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Exosc10P56960 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Exosc10P56960 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Exosc10P56960 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Exosc10P56960 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Exosc10P56960 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Exosc10P56960 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Exosc10P56960 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Exosc10P56960 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Exosc10P56960 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Exosc10P56960 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Exosc10P56960 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Exosc10P56960 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Exosc10P56960 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Exosc10P56960 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Exosc10P56960 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Exosc10P56960 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Exosc10P56960 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Exosc10P56960 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Exosc10P56960 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Exosc10P56960 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Exosc10P56960 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Exosc10P56960 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Exosc10P56960 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Exosc10P56960 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Exosc10P56960 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Exosc10P56960 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Exosc10P56960 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Exosc10P56960 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Exosc10P56960 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Exosc10P56960 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms