Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp5P56399 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp5P56399 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp5P56399 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp5P56399 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp5P56399 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp5P56399 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp5P56399 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp5P56399 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp5P56399 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp5P56399 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp5P56399 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp5P56399 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp5P56399 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp5P56399 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp5P56399 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp5P56399 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp5P56399 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp5P56399 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp5P56399 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp5P56399 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp5P56399 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp5P56399 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp5P56399 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp5P56399 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp5P56399 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp5P56399 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp5P56399 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp5P56399 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp5P56399 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp5P56399 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp5P56399 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp5P56399 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp5P56399 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp5P56399 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp5P56399 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp5P56399 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp5P56399 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp5P56399 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp5P56399 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp5P56399 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp5P56399 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp5P56399 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp5P56399 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp5P56399 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp5P56399 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp5P56399 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp5P56399 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp5P56399 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp5P56399 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp5P56399 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp5P56399 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp5P56399 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp5P56399 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp5P56399 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp5P56399 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp5P56399 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp5P56399 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp5P56399 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp5P56399 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp5P56399 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp5P56399 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp5P56399 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp5P56399 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp5P56399 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp5P56399 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp5P56399 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp5P56399 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp5P56399 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp5P56399 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp5P56399 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp5P56399 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp5P56399 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp5P56399 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp5P56399 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp5P56399 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp5P56399 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp5P56399 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.9 ms