Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
FmodP50608 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
FmodP50608 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
FmodP50608 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
FmodP50608 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
FmodP50608 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
FmodP50608 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
FmodP50608 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
FmodP50608 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
FmodP50608 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
FmodP50608 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
FmodP50608 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
FmodP50608 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
FmodP50608 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
FmodP50608 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
FmodP50608 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
FmodP50608 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
FmodP50608 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
FmodP50608 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
FmodP50608 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
FmodP50608 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
FmodP50608 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
FmodP50608 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
FmodP50608 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
FmodP50608 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
FmodP50608 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
FmodP50608 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
FmodP50608 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
FmodP50608 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
FmodP50608 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
FmodP50608 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
FmodP50608 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
FmodP50608 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
FmodP50608 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
FmodP50608 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
FmodP50608 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
FmodP50608 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
FmodP50608 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
FmodP50608 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
FmodP50608 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
FmodP50608 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
FmodP50608 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
FmodP50608 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
FmodP50608 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
FmodP50608 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
FmodP50608 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
FmodP50608 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
FmodP50608 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
FmodP50608 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
FmodP50608 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
FmodP50608 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
FmodP50608 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
FmodP50608 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
FmodP50608 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
FmodP50608 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
FmodP50608 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
FmodP50608 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
FmodP50608 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
FmodP50608 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
FmodP50608 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
FmodP50608 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
FmodP50608 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
FmodP50608 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
FmodP50608 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
FmodP50608 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
FmodP50608 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
FmodP50608 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
FmodP50608 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
FmodP50608 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
FmodP50608 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
FmodP50608 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
FmodP50608 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
FmodP50608 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
FmodP50608 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
FmodP50608 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
FmodP50608 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
FmodP50608 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
FmodP50608 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
FmodP50608 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
FmodP50608 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
FmodP50608 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
FmodP50608 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
FmodP50608 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
FmodP50608 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
FmodP50608 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
FmodP50608 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
FmodP50608 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
FmodP50608 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
FmodP50608 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
FmodP50608 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
FmodP50608 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
FmodP50608 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
FmodP50608 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
FmodP50608 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
FmodP50608 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
FmodP50608 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
FmodP50608 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
FmodP50608 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
FmodP50608 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
FmodP50608 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms