Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SftpdP50404 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SftpdP50404 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SftpdP50404 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SftpdP50404 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SftpdP50404 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SftpdP50404 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SftpdP50404 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SftpdP50404 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SftpdP50404 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SftpdP50404 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SftpdP50404 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SftpdP50404 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SftpdP50404 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SftpdP50404 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SftpdP50404 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SftpdP50404 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SftpdP50404 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SftpdP50404 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SftpdP50404 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SftpdP50404 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SftpdP50404 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SftpdP50404 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SftpdP50404 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SftpdP50404 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SftpdP50404 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SftpdP50404 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SftpdP50404 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SftpdP50404 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SftpdP50404 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SftpdP50404 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SftpdP50404 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SftpdP50404 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SftpdP50404 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SftpdP50404 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SftpdP50404 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SftpdP50404 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SftpdP50404 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SftpdP50404 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SftpdP50404 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SftpdP50404 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SftpdP50404 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SftpdP50404 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SftpdP50404 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SftpdP50404 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SftpdP50404 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SftpdP50404 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SftpdP50404 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SftpdP50404 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SftpdP50404 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SftpdP50404 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SftpdP50404 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SftpdP50404 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SftpdP50404 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SftpdP50404 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SftpdP50404 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SftpdP50404 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SftpdP50404 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SftpdP50404 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SftpdP50404 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SftpdP50404 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SftpdP50404 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SftpdP50404 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SftpdP50404 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SftpdP50404 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SftpdP50404 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SftpdP50404 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SftpdP50404 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SftpdP50404 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SftpdP50404 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SftpdP50404 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SftpdP50404 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SftpdP50404 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SftpdP50404 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SftpdP50404 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SftpdP50404 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SftpdP50404 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SftpdP50404 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SftpdP50404 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SftpdP50404 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SftpdP50404 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SftpdP50404 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SftpdP50404 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SftpdP50404 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SftpdP50404 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SftpdP50404 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SftpdP50404 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SftpdP50404 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SftpdP50404 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SftpdP50404 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SftpdP50404 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SftpdP50404 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SftpdP50404 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SftpdP50404 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SftpdP50404 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SftpdP50404 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SftpdP50404 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SftpdP50404 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SftpdP50404 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SftpdP50404 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms