Protein–RNA interactions for Protein: P48379

Rfx2, DNA-binding protein RFX2, mousemouse

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Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx2P48379 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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