Protein–RNA interactions for Protein: P48031

Gbx2, Homeobox protein GBX-2, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx2P48031 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gbx2P48031 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gbx2P48031 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gbx2P48031 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gbx2P48031 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gbx2P48031 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gbx2P48031 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gbx2P48031 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gbx2P48031 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gbx2P48031 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gbx2P48031 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gbx2P48031 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gbx2P48031 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gbx2P48031 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gbx2P48031 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gbx2P48031 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gbx2P48031 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gbx2P48031 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gbx2P48031 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gbx2P48031 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gbx2P48031 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gbx2P48031 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gbx2P48031 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gbx2P48031 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gbx2P48031 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gbx2P48031 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gbx2P48031 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gbx2P48031 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gbx2P48031 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gbx2P48031 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gbx2P48031 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gbx2P48031 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gbx2P48031 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gbx2P48031 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gbx2P48031 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gbx2P48031 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gbx2P48031 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gbx2P48031 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gbx2P48031 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gbx2P48031 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gbx2P48031 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gbx2P48031 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gbx2P48031 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gbx2P48031 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gbx2P48031 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gbx2P48031 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gbx2P48031 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gbx2P48031 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gbx2P48031 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gbx2P48031 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gbx2P48031 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gbx2P48031 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gbx2P48031 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gbx2P48031 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gbx2P48031 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gbx2P48031 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gbx2P48031 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gbx2P48031 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gbx2P48031 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gbx2P48031 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gbx2P48031 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gbx2P48031 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gbx2P48031 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gbx2P48031 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gbx2P48031 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gbx2P48031 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gbx2P48031 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gbx2P48031 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gbx2P48031 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gbx2P48031 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gbx2P48031 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gbx2P48031 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gbx2P48031 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gbx2P48031 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gbx2P48031 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gbx2P48031 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gbx2P48031 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gbx2P48031 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gbx2P48031 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gbx2P48031 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gbx2P48031 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gbx2P48031 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gbx2P48031 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gbx2P48031 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gbx2P48031 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gbx2P48031 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gbx2P48031 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gbx2P48031 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gbx2P48031 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gbx2P48031 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gbx2P48031 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gbx2P48031 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gbx2P48031 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gbx2P48031 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gbx2P48031 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gbx2P48031 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gbx2P48031 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gbx2P48031 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gbx2P48031 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gbx2P48031 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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