Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
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