Protein–RNA interactions for Protein: P30999

Ctnnd1, Catenin delta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd1P30999 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctnnd1P30999 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ctnnd1P30999 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctnnd1P30999 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ctnnd1P30999 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ctnnd1P30999 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctnnd1P30999 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ctnnd1P30999 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctnnd1P30999 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctnnd1P30999 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctnnd1P30999 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctnnd1P30999 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctnnd1P30999 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ctnnd1P30999 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ctnnd1P30999 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctnnd1P30999 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctnnd1P30999 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctnnd1P30999 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctnnd1P30999 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ctnnd1P30999 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctnnd1P30999 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctnnd1P30999 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctnnd1P30999 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctnnd1P30999 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctnnd1P30999 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctnnd1P30999 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctnnd1P30999 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctnnd1P30999 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctnnd1P30999 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctnnd1P30999 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctnnd1P30999 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctnnd1P30999 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctnnd1P30999 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctnnd1P30999 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctnnd1P30999 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctnnd1P30999 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctnnd1P30999 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctnnd1P30999 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctnnd1P30999 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctnnd1P30999 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctnnd1P30999 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ctnnd1P30999 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctnnd1P30999 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctnnd1P30999 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctnnd1P30999 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctnnd1P30999 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctnnd1P30999 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctnnd1P30999 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctnnd1P30999 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctnnd1P30999 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ctnnd1P30999 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ctnnd1P30999 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ctnnd1P30999 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ctnnd1P30999 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctnnd1P30999 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctnnd1P30999 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ctnnd1P30999 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ctnnd1P30999 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ctnnd1P30999 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctnnd1P30999 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctnnd1P30999 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctnnd1P30999 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctnnd1P30999 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctnnd1P30999 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctnnd1P30999 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctnnd1P30999 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ctnnd1P30999 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctnnd1P30999 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctnnd1P30999 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ctnnd1P30999 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctnnd1P30999 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctnnd1P30999 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctnnd1P30999 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctnnd1P30999 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Ctnnd1P30999 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ctnnd1P30999 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ctnnd1P30999 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ctnnd1P30999 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ctnnd1P30999 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Ctnnd1P30999 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ctnnd1P30999 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ctnnd1P30999 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ctnnd1P30999 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctnnd1P30999 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctnnd1P30999 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ctnnd1P30999 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ctnnd1P30999 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctnnd1P30999 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ctnnd1P30999 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctnnd1P30999 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctnnd1P30999 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ctnnd1P30999 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ctnnd1P30999 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctnnd1P30999 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctnnd1P30999 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctnnd1P30999 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctnnd1P30999 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ctnnd1P30999 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ctnnd1P30999 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctnnd1P30999 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.1 ms