Protein–RNA interactions for Protein: P28309

Defa2, Alpha-defensin 2, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa2P28309 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa2P28309 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa2P28309 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa2P28309 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa2P28309 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa2P28309 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms