Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PparaP23204 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PparaP23204 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PparaP23204 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PparaP23204 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PparaP23204 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PparaP23204 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PparaP23204 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PparaP23204 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PparaP23204 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PparaP23204 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PparaP23204 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PparaP23204 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PparaP23204 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PparaP23204 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PparaP23204 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PparaP23204 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PparaP23204 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PparaP23204 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PparaP23204 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PparaP23204 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PparaP23204 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PparaP23204 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PparaP23204 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PparaP23204 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PparaP23204 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PparaP23204 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PparaP23204 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PparaP23204 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PparaP23204 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PparaP23204 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PparaP23204 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PparaP23204 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PparaP23204 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PparaP23204 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PparaP23204 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PparaP23204 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PparaP23204 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PparaP23204 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PparaP23204 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PparaP23204 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PparaP23204 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PparaP23204 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PparaP23204 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PparaP23204 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PparaP23204 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PparaP23204 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PparaP23204 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PparaP23204 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PparaP23204 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PparaP23204 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PparaP23204 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PparaP23204 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PparaP23204 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PparaP23204 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PparaP23204 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PparaP23204 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PparaP23204 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PparaP23204 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PparaP23204 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PparaP23204 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PparaP23204 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PparaP23204 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PparaP23204 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PparaP23204 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PparaP23204 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PparaP23204 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PparaP23204 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PparaP23204 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PparaP23204 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PparaP23204 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PparaP23204 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PparaP23204 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PparaP23204 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PparaP23204 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PparaP23204 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PparaP23204 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PparaP23204 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PparaP23204 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PparaP23204 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PparaP23204 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PparaP23204 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PparaP23204 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PparaP23204 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PparaP23204 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PparaP23204 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PparaP23204 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PparaP23204 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PparaP23204 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PparaP23204 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PparaP23204 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PparaP23204 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PparaP23204 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PparaP23204 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PparaP23204 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PparaP23204 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PparaP23204 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PparaP23204 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PparaP23204 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PparaP23204 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms