Protein–RNA interactions for Protein: P23116

Eif3a, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3aP23116 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms