Protein–RNA interactions for Protein: P18528

Ig heavy chain V region 6.96, mousemouse

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Length 98 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18528 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18528 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18528 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18528 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18528 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18528 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18528 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18528 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
P18528 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
P18528 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
P18528 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18528 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18528 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
P18528 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18528 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18528 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18528 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18528 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18528 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18528 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18528 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18528 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18528 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18528 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18528 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18528 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18528 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18528 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18528 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18528 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18528 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18528 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18528 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18528 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18528 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18528 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18528 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
P18528 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18528 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18528 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18528 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18528 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18528 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18528 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18528 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18528 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18528 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18528 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18528 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18528 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18528 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18528 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
P18528 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18528 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18528 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18528 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18528 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18528 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
P18528 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18528 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18528 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18528 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18528 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18528 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18528 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18528 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18528 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18528 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18528 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18528 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
P18528 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
P18528 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
P18528 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
P18528 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
P18528 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
P18528 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18528 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18528 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18528 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18528 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18528 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18528 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18528 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18528 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18528 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18528 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18528 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
P18528 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18528 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
P18528 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18528 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18528 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18528 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18528 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18528 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18528 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18528 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18528 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
P18528 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
P18528 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms