Protein–RNA interactions for Protein: P17679

Gata1, Erythroid transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata1P17679 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gata1P17679 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gata1P17679 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gata1P17679 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gata1P17679 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gata1P17679 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gata1P17679 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gata1P17679 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gata1P17679 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gata1P17679 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gata1P17679 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gata1P17679 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gata1P17679 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gata1P17679 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gata1P17679 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gata1P17679 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gata1P17679 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gata1P17679 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gata1P17679 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gata1P17679 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gata1P17679 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gata1P17679 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gata1P17679 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gata1P17679 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gata1P17679 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gata1P17679 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gata1P17679 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gata1P17679 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gata1P17679 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gata1P17679 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gata1P17679 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gata1P17679 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gata1P17679 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gata1P17679 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gata1P17679 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gata1P17679 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gata1P17679 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gata1P17679 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gata1P17679 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gata1P17679 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gata1P17679 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gata1P17679 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gata1P17679 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gata1P17679 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gata1P17679 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gata1P17679 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gata1P17679 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gata1P17679 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gata1P17679 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gata1P17679 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gata1P17679 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gata1P17679 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gata1P17679 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gata1P17679 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gata1P17679 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gata1P17679 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gata1P17679 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gata1P17679 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gata1P17679 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gata1P17679 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gata1P17679 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gata1P17679 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gata1P17679 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gata1P17679 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gata1P17679 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gata1P17679 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gata1P17679 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gata1P17679 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gata1P17679 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gata1P17679 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gata1P17679 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gata1P17679 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gata1P17679 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gata1P17679 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gata1P17679 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gata1P17679 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gata1P17679 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gata1P17679 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gata1P17679 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gata1P17679 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gata1P17679 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gata1P17679 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gata1P17679 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gata1P17679 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gata1P17679 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gata1P17679 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gata1P17679 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gata1P17679 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gata1P17679 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gata1P17679 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gata1P17679 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gata1P17679 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gata1P17679 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gata1P17679 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gata1P17679 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gata1P17679 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gata1P17679 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gata1P17679 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gata1P17679 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gata1P17679 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms