Protein–RNA interactions for Protein: P12658

Calb1, Calbindin, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb1P12658 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Calb1P12658 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Calb1P12658 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Calb1P12658 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Calb1P12658 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Calb1P12658 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Calb1P12658 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Calb1P12658 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Calb1P12658 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Calb1P12658 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Calb1P12658 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Calb1P12658 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Calb1P12658 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Calb1P12658 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Calb1P12658 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Calb1P12658 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Calb1P12658 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Calb1P12658 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Calb1P12658 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Calb1P12658 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Calb1P12658 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Calb1P12658 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Calb1P12658 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Calb1P12658 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Calb1P12658 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Calb1P12658 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Calb1P12658 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Calb1P12658 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Calb1P12658 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Calb1P12658 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Calb1P12658 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Calb1P12658 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Calb1P12658 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Calb1P12658 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Calb1P12658 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Calb1P12658 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Calb1P12658 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Calb1P12658 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Calb1P12658 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Calb1P12658 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Calb1P12658 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Calb1P12658 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Calb1P12658 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Calb1P12658 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Calb1P12658 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Calb1P12658 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Calb1P12658 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Calb1P12658 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Calb1P12658 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Calb1P12658 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Calb1P12658 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Calb1P12658 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Calb1P12658 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Calb1P12658 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Calb1P12658 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Calb1P12658 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.07■□□□□ 0
Calb1P12658 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Calb1P12658 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Calb1P12658 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Calb1P12658 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Calb1P12658 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Calb1P12658 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Calb1P12658 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Calb1P12658 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Calb1P12658 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Calb1P12658 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Calb1P12658 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Calb1P12658 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Calb1P12658 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Calb1P12658 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Calb1P12658 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Calb1P12658 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Calb1P12658 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Calb1P12658 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Calb1P12658 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Calb1P12658 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Calb1P12658 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Calb1P12658 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Calb1P12658 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Calb1P12658 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Calb1P12658 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Calb1P12658 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Calb1P12658 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Calb1P12658 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Calb1P12658 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Calb1P12658 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Calb1P12658 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Calb1P12658 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Calb1P12658 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Calb1P12658 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Calb1P12658 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Calb1P12658 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms