Protein–RNA interactions for Protein: P10400

Pol, Retrovirus-related Pol polyprotein (Fragment), mousemouse

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Length 120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP10400 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PolP10400 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PolP10400 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PolP10400 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PolP10400 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PolP10400 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PolP10400 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PolP10400 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
PolP10400 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
PolP10400 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
PolP10400 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
PolP10400 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
PolP10400 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
PolP10400 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PolP10400 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PolP10400 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PolP10400 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PolP10400 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PolP10400 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PolP10400 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PolP10400 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PolP10400 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PolP10400 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PolP10400 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PolP10400 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
PolP10400 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PolP10400 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PolP10400 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PolP10400 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PolP10400 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PolP10400 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PolP10400 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
PolP10400 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PolP10400 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PolP10400 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PolP10400 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PolP10400 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PolP10400 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PolP10400 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PolP10400 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PolP10400 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PolP10400 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PolP10400 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PolP10400 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PolP10400 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PolP10400 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PolP10400 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PolP10400 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PolP10400 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PolP10400 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PolP10400 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
PolP10400 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PolP10400 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PolP10400 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PolP10400 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
PolP10400 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PolP10400 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PolP10400 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PolP10400 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PolP10400 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PolP10400 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PolP10400 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PolP10400 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PolP10400 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PolP10400 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PolP10400 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PolP10400 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PolP10400 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PolP10400 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PolP10400 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PolP10400 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PolP10400 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PolP10400 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
PolP10400 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PolP10400 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PolP10400 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PolP10400 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PolP10400 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PolP10400 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PolP10400 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PolP10400 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PolP10400 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PolP10400 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PolP10400 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PolP10400 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PolP10400 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PolP10400 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PolP10400 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PolP10400 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PolP10400 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PolP10400 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PolP10400 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PolP10400 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PolP10400 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PolP10400 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PolP10400 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PolP10400 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PolP10400 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PolP10400 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PolP10400 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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