Protein–RNA interactions for Protein: P0DP43

Catspere, Cation channel sperm-associated protein subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatspereP0DP43 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms